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规格:/Twist 文库制备酶切片段化 (EF) 试剂盒 2.0 旨在帮助您更高效地开展测序流程,获得更准确的新一代测序 (NGS) 结果。与原 Twist 文库制备 EF 试剂盒 1.0 相比,此次更新的试剂盒具有多种优势。除新的片段化和连接模块外,升级后的试剂盒现在还包括 Equinox 文库制备扩增预混液。这种热启动酶制剂在低输入体积下错误率更低*,且效率更高,因此非常适合 FFPE 等需要高效率和高产量的样本。
该试剂盒简化的工作流程将文库制备步骤合并为一个单管反应,再加上低嵌合体率和 Twist 高度均一的靶向富集工作流程,确保您实现更高质量的文库制备,获得更可靠的测序结果。
文库制备工作流程
Twist 文库制备 EF 试剂盒 2.0 包含进行末端修复、dA 加尾、接头连接和文库扩增所需的试剂。试剂盒还包含 gDNA 样本片段化所需的酶,可以用于调节插入片段大小。构建核心文库之后,可使用全长或通用接头来满足您的应用需求。
主要优势
简化您的工作流程
? DNA 样本起始量灵活:1 ng– 500 ng
? 3 小时即可将 DNA 样本转化为稳定的扩增文库
? 单管式文库制备操作,提高效率,获得一致结果
稳定、高产量扩增
? 热启动酶制剂,在样本起始量较低时实现高效产出
? 文库制备过程中 GC 含量耐受性范围高 (20%–80%)
? 与常用的聚合酶相比,错误率更低
高均一性,低嵌合率
? 搭配 Twist 靶向富集工作流程,实现高度均一的扩增
? 更可靠地检测实际存在的嵌合体
? 能从高度复杂的文库中获得一致的产出,具有良好的灵敏度和特异性
保持中靶率
Twist 文库制备 EF 试剂盒 2.0 的中靶率与 Twist 文库制备 EF 试剂盒 1.0 的中靶率相当。这里比较了不同杂交条件下的中靶片段比例。
靶向富集使用 Twist 核心外显子组组合和 Twist 通用接头系统进行。测序使用 NextSeq? 550 或 2000 平台完成。将数据降至 150x 的靶向覆盖深度,并使用 Picard Metrics 进行分析。误差线表示重复样本间的标准差。
降低嵌合率,减少测序错误
在文库制备过程中,尽可能减少不合适的 DNA 连接或重组可以将嵌合体导致的测序错误降至**。如图所示,与 Twist 文库制备 EF 试剂盒 1.0 相比,升级版 Twist 文库制备 EF 试剂盒 2.0 可显著降低嵌合测序片段比例。且其文库制备的嵌合率与机械片段化相近。
NGS 文库通过 Twist 酶切片段化文库制备试剂盒 1.0、Twist 酶切片段化文库制备试剂盒 2.0 或 Twist 机械片段化文库制备试剂盒生成。靶向富集使用 Twist 核心外显子组组合和 Twist 通用接头系统进行。使用 NextSeq? 2000 平台完成测序。将数据降至 150x 的靶向覆盖深度,并展示 Picard Metrics PCT_CHIMERAS 数据。误差线表示重复样本间的标准差。
始终如一的性能
可重复的性能确保了结果的可靠性。当实验条件保持不变时,Twist 文库制备 EF 试剂盒 2.0 可产生稳定、一致的 DNA 文库片段大小。如图所示为使用此试剂盒生成的 8 个不同 NGS 文库的电泳图。荧光曲线的重叠显示文库制备具有一致性,可以在运行之间实现。
NGS 文库使用 Twist 文库制备 EF 试剂盒 2.0 和 Twist 通用接头系统制备而成。在 37°C 下,对 50 ng 高质量 gDNA 进行片段化处理,持续 20 分钟,再进行 6 个PCR循环扩增。使用 Agilent DNA 7500 检测方法分析样本,使用 Expert 2100 软件分析结果。
调整片段大小,满足您的实验需求
使用 Twist 文库制备 EF 试剂盒 2.0,仅需调整片段化时间,即可根据您的具体需求调节 DNA 文库片段大小。如图所示是采用不同的片段化时间获得的 4 个 NGS 文库的电泳图。
NGS 文库使用 Twist 文库制备 EF 试剂盒 2.0 和 Twist 通用接头系统制备而成。在 37°C 下,按照不同的时长对 50 ng 高质量 gDNA 进行片段化处理,再进行 6 个 PCR 循环扩增。使用 Agilent DNA 7500 检测方法分析样本,使用 Expert 2100 软件分析结果。
优化文库扩增,尽可能减少测序错误
扩增期间产生错误不可避免,但错误并非时常出现。升级版 Twist 文库制备 EF 试剂盒 2.0 包含 Equinox 反应预混液,其中含有高保真的热启动酶。与之前推荐和常用的聚合酶相比,Equinox 反应预混液的错误率更低,错误插入的碱基更少。这意味着它能实现更精准的扩增,从而获得值得信赖的测序数据。
采用专有的 NGS 分析方法来检测大量错配碱基对中的碱基错配事件。给出的数值代表所有错配事件的平均错误率。